Poiché il collagene è altamente conservato nell'evoluzione biologica, la struttura del collagene di pesce è simile ad altri collageni, ponendo una base strutturale per la sua parziale sostituzione del collagene di origine mammifera per la medicina traslazionale.Prendendo come esempio il collagene di pesce di tipo I, la sua molecola ha una tipica tripla elica, che è la struttura [α1][α2], e i pesi molecolari di α1 e α2 sono rispettivamente di circa 120 kDa e 110 kDa.Tuttavia, a differenza dei mammiferi come maiali e bovini, i pesci sono animali ectotermici e anche la loro struttura di collagene è specifica e il contenuto di iminoacidi (la somma del contenuto di prolina e idrossiprolina) nella sua composizione di aminoacidi è significativamente inferiore a quello del collagene derivato da mammiferi terrestri, presenta quindi un basso grado di reticolazione intermolecolare e scarsa stabilità termica.

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